有的廠家習慣在生產之前對生產環境進行清潔，防止在生產過程中材料和設備受到影響。有的廠家則是在生產完成之后對生產環境進行清潔，清潔在生產過程中產生的污染，也為下次生產操作做好準備。GMP無塵車間和普通生產車間的環境不同的地方就在于其潔凈度是較高的，那么GMP無塵車間是適用在生產之前清潔還是在生產之后清潔呢？

    實際上這兩種觀點都有人支持，支持生產前清潔的人認為，GMP無塵車間雖然潔凈度較高，但在使用之中還是不可避免地會產生一定的灰塵，生產之前清潔就是為生產過程清除這些灰塵的影響。支持生產后清潔的人則認為，GMP無塵車間本身的潔凈度就較高，不需要生產之前清潔，反而是生產過程產生的污染物需要在生產完成后進行清理。

    實際上這兩者觀點都存在一定的道理，實際的操作其實是要根據GMP無塵車間的潔凈等級以及生產操作的行業來決定的。例如潔凈等級高的GMP無塵車間就不需要在生產之前清潔，因為這類GMP無塵車間的自凈設備會將環境凈化到一定的程度，已經是 適合生產的了。而且一些生產時散發粉塵較大行業則需要在生產完成之后進行清潔。